JSmol による分子振動の表示 (Gaussian 03による計算結果)について

1.はじめに

 本データ集の分子構造データは、分子軌道法計算ソフトウェア Gaussian 03Wを利用し、B3LYP/6-31G*法 によって最適化したものです。

 データの利用については制限を設けませんが、データ集全体の転載はご遠慮ください。

2.分子振動の表示の仕方とJSmol ウィンドウでの操作法について

 メニュー画面で、ファイル名(登録コード)をクリックすると、分子が表示されます。

たとえば、エチレンの分子モデルと分子振動を表示するには、

a  鎖式化合物 → a1:  炭化水素 →  a1-2-1:  モノオレフィン  とリンクを辿って、エチレンの登録コード a0001 をクリックします。

Vibrarionの左側のボタンをチェックすると、分子振動のアニメーションが表示されます。Lowerボタンをクリックすると、
より低波数の振動が表示されます。Showボタンをクリックすると、振動の番号と波数が表示されます。

画面上のボタンやメニューを利用して、アニメーションを表示したり、表示条件を変更することができます
。Help アイコンをクリックすると、使い方に関する情報などが別ウィンドウで表示されます。

※ ファイルをダウンロードして、他のプログラムで利用することもできます。

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