Avogadroでの[Extensions]メニューの説明

[Animation] Trajectoryファイルを読み込んで、アニメーションを表示する
[Optimize Geometry] 構造最適化を行う
[Molecular Mechanics] ▶  
  Setup Force Field - 力場の種類と条件を設定する
  Calculate Energy - エネルギーを計算する
  Conformer Search - 配座異性体を探索する
  Constraints - 制約条件を課す
  Ignore Selection - 選択を無視する
  Fix Selected Atoms - 選択された原子を固定する
[GAMESS] ▶  
  Input Generator - 入力データの作成
  EFP Selection
  QM Selection
[Abinit] 入力データの作成
[Dalton] 入力データの作成
[GAMESS-UK] 入力データの作成
[Gaussian] 入力データの作成
[MOLPRO] 入力データの作成
MOPAC MOPAC入力データの作成
[NWChem] 入力データの作成
[PSI4] 入力データの作成
[Q-Chem] 入力データの作成
[LAMMPS] 入力データの作成
[Molecular Orbitals] 分子軌道
[Orca] Orca
[QTAIM] ▶ Atoms in Molecules Analysis
  Molecular Graph
  Molecular Graph with Lone Pairs
  Atomic Charge
[GLSL Shaders] ▶ GLSL Shaders
[Spectra] スペクトルを表示する
[Create Surfaces] Van der Waals表面を計算して表示する

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