Avogadroによる Cis-デカリンの分子構造の構築
- Element として Carbon (6) が選択されていて、Adjust Hydrogens がチェックされていることを確認してください。
- メニューから、[Build] - [Insert] -[Fragment]を選択します。
- Cyclic Alkanes から Cyclohexane Chair を選択し、ダブルクリックするかまたは [Insert]ボタンをクリックします。
- シクロヘキサンの構造ができました。選択を解除し、Selection Tool で水素原子を選択します。
- メニューから、[Build] - [Insert] -[Fragment]を選択します。
- Cyclic Alkanes から Cyclohexane Chair を選択し、ダブルクリックするかまたは [Insert]ボタンをクリックします。
シクロヘキサン環が結合されました。
- Draw Tool
を選択し、右クリックで余分な炭素原子を削除します。
- 炭素間の結合を作成します。結合する炭素原子の間をドラッグします。
- 炭素間に結合が形成されました。
メニューから、[Extensions] - [Optimize Geometry] を選択して、構造最適化を行います。
- cis-デカリンの構造が作成されました。
