Winmostarによる計算化学実験　−　MOPAC 初級編-１

エチレン分子の構造の作成

1. ファイルメニューから、「新規」を選択します。

2. 置換基メニューの「-C2H3」ボタンをクリックし置換基を指定します。

3. [Rep]ボタンをクリックするか炭素原子を右クリックします。 エチレンの構造ができました。
4. 

4. MOPAC計算のキーワード行（テキストエリアの1行目）を、「PM6 PRECISE　GRAPHF」と変更します。（MOPAC Ver.6の場合は、「PM3 PRECISE EF?GRAPHF」とします。)
   MOPAC 2009では、計算方法としてPM6がデフォールトとなっているので指定する必要はないのですが、分かりやすいようにPM6を指定しています。
5. タイトル行（テキストエリアの３行目）を、「Ethylene Optimization」と変更します。

6. ファイルメニューから「名前を付けて保存」を選択し、「ethylene.dat」の名前で保存します。（注：ファイル名は" ethylene "だけを入力すればよい）

MOPAC 2012 キーワード

• PM6　−　計算方法としてPM6がデフォールトとなっているので指定する必要はないのですが、分かりやすいようにPM6を指定しています。
• PRECISE　−　構造最適化の閾値を100倍厳しく設定します。
• GRAPHF　−　Jmolなどを利用して波動関数や電子密度の等高線図を描くためのデータのファイル出力を指定します。

MOPAC 2009による分子軌道法計算の実行

1. [計算]メニューから[(2)MOPAC 2012 Start]　を選びます。（あるいは、[(1)MOP6W70 Start]　など）
   画面にDOS窓が現れて計算が始まります。（下の図は別な分子についての計算例です。）

2. 計算が終わると、計算結果が書かれたOutファイルが テキストエディタで開かれます。
3. 構造最適化計算が正常終了すると、最適化された構造が自動的に読み込まれ、分子表示ウィンドウに表示されます。
4. 分子を回転させ、少し拡大します。この場合の回転は、メニューから「編集」−「回転方法」−「Z軸回転」を指定すると楽に行えます。

　回転や拡大の際のマウスの使い方については、マウスの使い方の説明を参照してください。

構造パラメータの計測

1. Numberにチェックを入れ、原子の番号を表示します。

2. 原子を順番にクリックすると、画面の左上に構造パラメータが表示されます。
   C−H結合距離は1.0817Å、∠H-C-Cは123.5°と表示されます。