Winmostarによる計算化学実験　－　構造作成編

下記の化合物については、プルダウンメニューからグループ（置換基）を選んで 指定するだけで構造を作成することができます。

• シクロプロパン、シクロブタン、シクロペンタン、シクロヘキサン、アダマンタン
• エチレン、シクロペンタジエン、ベンゼン、ナフタレン
• グルコース

• 脂肪族鎖状炭化水素
  • 2-メチルプロパン（イソブタン）
• 脂肪族環状炭化水素
  • cis-デカリン
• アルコール、アルデヒド、カルボン酸
  • エタノール、アセトアルデヒド、酢酸
• ハロゲン置換体
  • γ-BHC
• 芳香族炭化水素
  • スチレン、アントラセン、コロネン

Winmostar 3.805vから、「水素付加」の中に座標調整機能が追加されました。これにより、ChemDraw等で作成したMOL(SDF)ファイルの座標を読み込み、「水素付加」と「クリーン」を適用して、適切な３次元構造を得ることができます。

Winmostarでは、PDB、MDL mol、MODRAST(MOLDA）形式などの分子構造データファイルを読み込むことができます。

多くの化合物について、PDB形式およびMODRAST(MOLDA)形式の分子構造データを公開しているので、ご利用ください。

• Jmol による分子モデルの表示 （PDB形式データ集）　　PDBファイルをダウンロードできます
• Jmol による分子軌道の表示 （Mopac 2009による計算結果）   　PDB、DAT、ARCファイルをダウンロードできます
• MODRAST（MOLDA)形式分子構造データ集 　　追加分についてはまだ記載していません。