Jmol で使われている色

元素の種類を表す色 | アミノ酸の色 | Shapely(均整配色)での色 | タンパク質と核酸の構造に対する色

電荷を表す色 | Jmolで使用できる色名

1. 元素の種類を表すのに使われている色

関連する命令:  color [object] cpk , set defaultColors Jmol , set defaultColors Rasmol

周期律表

H He
Li Be B C N O F Ne
Na Mg Al Si P S Cl Ar
K Ca Sc Ti V Cr Mn Fe Co Ni Cu Zn Ga Ge As Se Br Kr
Rb Sr Y Zr Nb Mo Tc Ru Rh Pd Ag Cd In Sn Sb Te I Xe
Cs Ba * Hf Ta W Re Os Ir Pt Au Hg Tl Pb Bi Po At Rn
Fr Ra ** Rf Db Sg Bh Hs Mt                  
 
  * La Ce Pr Nd Pm Sm Eu Gd Tb Dy Ho Er Tm Yb Lu  
  ** Ac Th Pa U Np Pu Am Cm Bk Cf Es Fm Md No Lr  

原子番号順

    Jmol Rasmol Rasmol
“CPKnew”
  記号 10進 16進     16進     16進  
1H[255,255,255]FFFFFF   FFFFFF     
2He[217,255,255]D9FFFF   FFC0CB     
3Li[204,128,255]CC80FF   B22222   B22121  
4Be[194,255,0]C2FF00   FF1493     
5B[255,181,181]FFB5B5   00FF00     
6C[144,144,144]909090   C8C8C8   D3D3D3  
7N[48,80,248]3050F8   8F8FFF   87CEE6  
8O[255,13,13]FF0D0D   F00000   FF0000  
9F[144,224,80]90E050   DAA520     
10Ne[179,227,245]B3E3F5   FF1493     
11Na[171,92,242]AB5CF2   0000FF     
12Mg[138,255,0]8AFF00   228B22     
13Al[191,166,166]BFA6A6   808090   696969  
14Si[240,200,160]F0C8A0   DAA520     
15P[255,128,0]FF8000   FFA500   FFAA00  
16S[255,255,48]FFFF30   FFC832   FFFF00  
17Cl[31,240,31]1FF01F   00FF00     
18Ar[128,209,227]80D1E3   FF1493     
19K[143,64,212]8F40D4   FF1493     
20Ca[61,255,0]3DFF00   808090   696969  
21Sc[230,230,230]E6E6E6   FF1493     
22Ti[191,194,199]BFC2C7   808090   696969  
23V[166,166,171]A6A6AB   FF1493     
24Cr[138,153,199]8A99C7   808090   696969  
25Mn[156,122,199]9C7AC7   808090   696969  
26Fe[224,102,51]E06633   FFA500   FFAA00  
27Co[240,144,160]F090A0   FF1493     
28Ni[80,208,80]50D050   A52A2A   802828  
29Cu[200,128,51]C88033   A52A2A   802828  
30Zn[125,128,176]7D80B0   A52A2A   802828  
31Ga[194,143,143]C28F8F   FF1493     
32Ge[102,143,143]668F8F   FF1493     
33As[189,128,227]BD80E3   FF1493     
34Se[255,161,0]FFA100   FF1493     
35Br[166,41,41]A62929   A52A2A   802828  
36Kr[92,184,209]5CB8D1   FF1493     
37Rb[112,46,176]702EB0   FF1493     
38Sr[0,255,0]00FF00   FF1493     
39Y[148,255,255]94FFFF   FF1493     
40Zr[148,224,224]94E0E0   FF1493     
41Nb[115,194,201]73C2C9   FF1493     
42Mo[84,181,181]54B5B5   FF1493     
43Tc[59,158,158]3B9E9E   FF1493     
44Ru[36,143,143]248F8F   FF1493     
45Rh[10,125,140]0A7D8C   FF1493     
46Pd[0,105,133]006985   FF1493     
47Ag[192,192,192]C0C0C0   808090   696969  
48Cd[255,217,143]FFD98F   FF1493     
49In[166,117,115]A67573   FF1493     
50Sn[102,128,128]668080   FF1493     
51Sb[158,99,181]9E63B5   FF1493     
52Te[212,122,0]D47A00   FF1493     
53I[148,0,148]940094   A020F0     
54Xe[66,158,176]429EB0   FF1493     
55Cs[87,23,143]57178F   FF1493     
56Ba[0,201,0]00C900   FFA500   FFAA00  
57La[112,212,255]70D4FF   FF1493     
58Ce[255,255,199]FFFFC7   FF1493     
59Pr[217,255,199]D9FFC7   FF1493     
60Nd[199,255,199]C7FFC7   FF1493     
61Pm[163,255,199]A3FFC7   FF1493     
62Sm[143,255,199]8FFFC7   FF1493     
63Eu[97,255,199]61FFC7   FF1493     
64Gd[69,255,199]45FFC7   FF1493     
65Tb[48,255,199]30FFC7   FF1493     
66Dy[31,255,199]1FFFC7   FF1493     
67Ho[0,255,156]00FF9C   FF1493     
68Er[0,230,117]00E675   FF1493     
69Tm[0,212,82]00D452   FF1493     
70Yb[0,191,56]00BF38   FF1493     
71Lu[0,171,36]00AB24   FF1493     
72Hf[77,194,255]4DC2FF   FF1493     
73Ta[77,166,255]4DA6FF   FF1493     
74W[33,148,214]2194D6   FF1493     
75Re[38,125,171]267DAB   FF1493     
76Os[38,102,150]266696   FF1493     
77Ir[23,84,135]175487   FF1493     
78Pt[208,208,224]D0D0E0   FF1493     
79Au[255,209,35]FFD123   DAA520     
80Hg[184,184,208]B8B8D0   FF1493     
81Tl[166,84,77]A6544D   FF1493     
82Pb[87,89,97]575961   FF1493     
83Bi[158,79,181]9E4FB5   FF1493     
84Po[171,92,0]AB5C00   FF1493     
85At[117,79,69]754F45   FF1493     
86Rn[66,130,150]428296   FF1493     
87Fr[66,0,102]420066   FF1493     
88Ra[0,125,0]007D00   FF1493     
89Ac[112,171,250]70ABFA   FF1493     
90Th[0,186,255]00BAFF   FF1493     
91Pa[0,161,255]00A1FF   FF1493     
92U[0,143,255]008FFF   FF1493     
93Np[0,128,255]0080FF   FF1493     
94Pu[0,107,255]006BFF   FF1493     
95Am[84,92,242]545CF2   FF1493     
96Cm[120,92,227]785CE3   FF1493     
97Bk[138,79,227]8A4FE3   FF1493     
98Cf[161,54,212]A136D4   FF1493     
99Es[179,31,212]B31FD4   FF1493     
100Fm[179,31,186]B31FBA   FF1493     
101Md[179,13,166]B30DA6   FF1493     
102No[189,13,135]BD0D87   FF1493     
103Lr[199,0,102]C70066   FF1493     
104Rf[204,0,89]CC0059   FF1493     
105Db[209,0,79]D1004F   FF1493     
106Sg[217,0,69]D90045   FF1493     
107Bh[224,0,56]E00038   FF1493     
108Hs[230,0,46]E6002E   FF1493     
109Mt[235,0,38]EB0026   FF1493     

2. タンパク質のアミノ酸の色の設定

関連する命令:  color [object] amino, color [object] shapely

タンパク質のアミノ酸ごとの色の設定

アミノ酸
記号
RGB Color
アラニン
Ala
#C8C8C8  
アルギニン
Arg
#145AFF  
アスパラギン
Asn
#00DCDC  
アスパラギン酸
Asp
#E60A0A  
システイン
Cys
#E6E600  
グルタミン
Gln
#00DCDC  
グルタミン酸
Glu
#E60A0A  
グリシン
Gly
#EBEBEB  
ヒスチジン
His
#8282D2  
イソロイシン
Ile
#0F820F  
ロイシン
Leu
#0F820F  
リシン
Lys
#145AFF  
メチオニン
Met
#E6E600  
フェニルアラニン
Phe
#3232AA  
プロリン
Pro
#DC9682  
セリン
Ser
#FA9600  
チロシン
Thr
#FA9600  
トリプトファン
Trp
#B45AB4  
チロシン
Tyr
#3232AA  
バリン
Val
#0F820F  
アスパラギン酸またはアスパラギン
Asx
#FF69B4  
グルタミン酸またはグルタミン
Glx
#FF69B4  
その他
Other
#BEA06E  

Shapely(均整配色)におけるタンパク質のアミノ酸および核酸の色の設定

アミノ酸
記号
RGB Color
アラニン
Ala
#8CFF8C  
アルギニン
Arg
#00007C  
アスパラギン
Asn
#FF7C70  
アスパラギン酸
Asp
#A00042  
システイン
Cys
#FFFF70  
グルタミン
Gln
#FF4C4C  
グルタミン酸
Glu
#660000  
グリシン
Gly
#FFFFFF  
ヒスチジン
His
#7070FF  
イソロイシン
Ile
#004C00  
ロイシン
Leu
#455E45  
リシン
Lys
#4747B8  
メチオニン
Met
#B8A042  
フェニルアラニン
Phe
#534C52  
プロリン
Pro
#525252  
セリン
Ser
#FF7042  
チロシン
Thr
#B84C00  
トリプトファン
Trp
#4F4600  
チロシン
Tyr
#8C704C  
バリン
Val
#FF8CFF  
アスパラギン酸またはアスパラギン
Asx
#FF00FF  
グルタミン酸またはグルタミン
Glx
#FF00FF  
その他
Other
#FF00FF  
核 酸
記号
RGB Color
アデニン
A
#A0A0FF  
グアニン
G
#FF7070  
 
I
#80FFFF  
シトシン
C
#FF8C4B  
チミン
T
#A0FFA0  
ウラシル
U
#FF8080  

3. タンパク質と核酸などの二次構造に対する色の設定

関連する命令:  color [object] chain

タンパク質

構 造 記号 RGB(10進) RGB(Hex) Color
α helix αヘリックス [255,0,128] #FF0080  
310 helix 310 ヘリックス [160,0,128] #A00080  
π helix π ヘリックス [96,0,128]< #600080  
β strand βストランド [96,0,128]< #FFC800  
(β) turn (β) ターン [96,128,255] #6080FF  
other その他 [255,255,255] #FFFFFF  

核酸

構 造 記号 RGB(10進) RGB(Hex) Color
DNA デオキシリボ核酸 [174,0,254] #AE00FE  
RNA リボ核酸 [253,1,98] #FD0162  

その他

構 造 記号 RGB(10進) RGB(Hex) Color
carbohydrate 糖類 [166,166,250] #A6A6FA  
other その他 [128,128,128] #808080  

4. 電荷

形式電荷

関連する命令:  color [object] formalCharge

電荷 RGB(10進) RGB(Hex) Color
    -4[255,0,0]FF0000  
    -3[255,64,64]FF4040  
    -2[255,128,128]FF8080  
    -1[255,192,192]FFC0C0  
    0[255,255,255]FFFFFF  
    1[216,216,255]D8D8FF  
    2[180,180,255]B4B4FF  
    3[144,144,255]9090FF  
    4[108,108,255]6C6CFF  
    5[72,72,255]4848FF  
    6[36,36,255]2424FF  
    7[0,0,255]0000FF  

部分電荷

関連する命令:  color [object] partialCharge

    負の電荷 正の電荷
                                                                            

値の範囲は電荷の最小値と最大値に合わせて調整されます。

5. Jmolで使用できる色名

通常のWebブラウザがサポートしている色名をアルファベット順に並べたものです

色名 RGB 色見本
AliceBlue #F0F8FF  
AntiqueWhite #FAEBD7  
Aqua #00FFFF  
Aquamarine #7FFFD4  
Azure #F0FFFF  
Beige #F5F5DC  
Bisque #FFE4C4  
Black #000000  
BlanchedAlmond #FFEBCD  
Blue #0000FF  
BlueTint #AFD7FF    
BlueViolet #8A2BE2  
Brown #A52A2A  
Burlywood #DEB887  
CadetBlue #5F9EA0  
Chartreuse #7FFF00  
Chocolate #D2691E  
Coral #FF7F50  
CornFlowerBlue #6495ED  
Cornsilk #FFF8DC  
Crimson #DC143C  
Cyan #00FFFF  
DarkBlue #00008B  
DarkCyan #008B8B  
DarkGoldenrod #B8860B  
DarkGray #A9A9A9  
DarkGreen #006400  
DarkKhaki #BDB76B  
DarkMagenta #8B008B  
DarkOliveGreen #556B2F  
DarkOrange #FF8C00  
DarkOrchid #9932CC  
DarkRed #8B0000  
DarkSalmon #E9967A  
DarkSeaGreen #8FBC8F  
DarkSlateBlue #483D8B  
DarkSlateGray #2F4F4F  
DarkTurquoise #00CED1  
DarkViolet #9400D3  
DeepPink #FF1493  
DeepSkyBlue #00BFFF  
DimGray #696969  
DodgerBlue #1E90FF  
Firebrick #B22222  
FloralWhite #FFFAF0  
ForestGreen #228B22  
Fuchsia #FF00FF  
Gainsboro #DCDCDC  
GhostWhite #F8F8FF  
Gold #FFD700  
Goldenrod #DAA520  
Gray #808080  
Green #008000  
GreenBlue #2E8B57  
GreenTint #98FFB3    
GreenYellow #ADFF2F  
Grey #808080  
Honeydew #F0FFF0  
HotPink #FF69B4  
IndianRed #CD5C5C  
Indigo #4B0082  
Ivory #FFFFF0  
Khaki #F0E68C  
Lavender #E6E6FA  
LavenderBlush #FFF0F5  
LawnGreen #7CFC00  
LemonChiffon #FFFACD  
LightBlue #ADD8E6  
LightCoral #F08080  
LightCyan #E0FFFF  
LightGoldenrodYellow #FAFAD2  
LightGreen #90EE90  
LightGrey #D3D3D3  
LightPink #FFB6C1  
LightSalmon #FFA07A  
LightSeaGreen #20B2AA  
LightSkyBlue #87CEFA  
LightSlateGray #778899  
LightSteelBlue #B0C4DE  
LightYellow #FFFFE0  
Lime #00FF00  
LimeGreen #32CD32  
Linen #FAF0E6  
Magenta #FF00FF  
Maroon #800000  
MediumAquamarine #66CDAA  
MediumBlue #0000CD  
MediumOrchid #BA55D3  
MediumPurple #9370DB  
MediumSeaGreen #3CB371  
MediumSlateBlue #7B68EE  
MediumSpringGreen #00FA9A  
MediumTurquoise #48D1CC  
MediumVioletRed #C71585  
MidnightBlue #191970  
MintCream #F5FFFA  
MistyRose #FFE4E1  
Moccasin #FFE4B5  
NavajoWhite #FFDEAD  
Navy #000080  
OldLace #FDF5E6  
Olive #808000  
OliveDrab #6B8E23  
Orange #FFA500  
OrangeRed #FF4500  
Orchid #DA70D6  
PaleGoldenrod #EEE8AA  
PaleGreen #98FB98  
PaleTurquoise #AFEEEE  
PaleVioletRed #DB7093  
PapayaWhip #FFEFD5  
PeachPuff #FFDAB9  
Peru #CD853F  
Pink #FFC0CB  
PinkTint #FFABBB  
Plum #DDA0DD  
PowderBlue #B0E0E6  
Purple #800080  
Red #FF0000  
RedOrange #FF4500  
RosyBrown #BC8F8F  
RoyalBlue #4169E1  
SaddleBrown #8B4513  
Salmon #FA8072  
SandyBrown #F4A460  
SeaGreen #2E8B57  
Seashell #FFF5EE  
Sienna #A0522D  
Silver #C0C0C0  
SkyBlue #87CEEB  
SlateBlue #6A5ACD  
SlateGray #708090  
Snow #FFFAFA  
SpringGreen #00FF7F  
SteelBlue #4682B4  
Tan #D2B48C  
Teal #008080  
Thistle #D8BFD8  
Tomato #FF6347  
Turquoise #40E0D0  
Violet #EE82EE  
Wheat #F5DEB3  
White #FFFFFF  
WhiteSmoke #F5F5F5  
Yellow #FFFF00  
YellowGreen #9ACD32  

上の色名のうち、Aqua と Cyan、Fuchsia と Magenta および Gray と Greyは同じ色を指します。

参考リンク

本ページの記述は、Jmol colors  http://jmol.sourceforge.net/jscolors/ にもとづいています。


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