AvogadroのToolのモードとマウス操作
Draw Tool
| 左ボタン | |
| クリック | 原子の追加 |
| 原子をクリックしたままドラッグ | 原子の追加と結合の生成 |
| 原子をクリックしたまま他の原子へドラッグ | 結合の生成 |
| 結合をクリック | 結合次数を増やす |
| Ctrl + クリック | 原子または結合の削除 |
| ダブルクリック | ビューのリセット |
| 右ボタン | |
| 原子をクリック | 原子の削除 |
| 結合をクリック | 結合の削除 |
| ホイール | |
| 上下 ドラッグ | 拡大・縮小 |
Navigation Tool
| 左ボタン | |
| 原子の上をクリック + ドラッグ | その原子の位置の周りに自由回転 |
| 原子以外の場所をクリック + ドラッグ | 重心の周りに自由回転 |
| Shift + 左右ドラッグ | 画面内（Z軸の周り）の回転 |
| Shift + 上下ドラッグ | 拡大・縮小 |
| Ctrl + ドラッグ | 移動 |
| ダブルクリック | ビューのリセット |
| 右ボタン | |
| クリック + ドラッグ | 分子全体の移動 |
| ホイール | |
| 上下 ドラッグ | 拡大・縮小 |
Bond Centric Maipulation Tool
| 左ボタン | |
| 原子をクリック | 角度を表示 |
| 結合をクリック | 結合を選択 |
| 結合をクリックしたのちドラッグ | 操作面を指定する |
| 結合を選択した後、結合の外側の原子をクリックしたままドラッグ | 結合の片側全体を回転する（二面角の変更） |
| ダブルクリック | ビューのリセット |
| 右ボタン | |
| 結合を選択した後、結合の外側の原子を右クリックしたままドラッグ | 選択した原子以下を回転する（二面角の変更） |
| 結合を選択した後、結合の片側の原子を右クリックしたままドラッグ | 結合距離を変更 |
| ホイール | |
| 上下 ドラッグ | 拡大・縮小 |
Maipulation Tool
| 左ボタン | |
| 原子をクリックしたままドラッグ | 原子の移動 |
| 原子以外の場所をクリックしてドラッグ | 分子全体の回転 |
| Ctrl + ドラッグ | 分子全体の移動 |
| ダブルクリック | ビューのリセット |
| 右ボタン | |
| 右クリックしたままドラッグ | 分子全体の移動 |
| ホイール | |
| 上下 ドラッグ | 拡大・縮小 |
Selection Tool
| 左ボタン | |
| クリック | 原子やフラグメントを選択 |
| ドラッグ | 矩形範囲を選択 |
| Shift + クリック | 追加選択 |
| Ctrl + クリック | 選択/選択の解除（トグル） |
| ダブルクリック | ビューのリセット |
| 右ボタン | |
| 原子以外の場所をクリック | 選択の解除 |
| 原子をクリック | 表示を変更する |
| ホイール | |
| 上下 ドラッグ | 拡大・縮小 |
回転方向
- 自由回転 ： ドラッグすると画面内の（マウスカーソルの移動方向に垂直な）軸のまわりで分子が回転します。
