［計算］メニューの説明
［計算］
| ［MOPACキーワード］▶ | ||
| ［Setup] | MOPACのキーワードを設定するウィンドウを表示します。 | |
| ［Import] | 保存済みのMOPAC形式データから、キーワード部分をインポートします。 | |
| ［Run with JM] | Winmostarでは利用できません。 | |
| ［(1)MOPAC6W70 start］ | 現在の分子構造・キーワードでMOPAC6入力ファイルを生成し計算を実行します。計算後は自動的に「パスの設定」−「エディター」で指定したエディタで出力ファイルが開かれます。 | |
| ［(2)MOPAC7W70 start］ | MOPAC7入力ファイルを生成し計算を実行します。または、[パスの設定] − [(2)MOPACのパス]で指定したプログラムを起動します。 | |
| ［(3)MOPACxxxx start］ | [パスの設定] − [(3)MOPACのパス]で指定したプログラムを起動します。 | |
| ［エディット out］ | MOPACの標準出力ファイル(.out)を指定エディタで開きます。 | |
| ［エディット arc］ | MOPACの出力要約ファイル(.arc)を指定エディタで開きます。 | |
| ［分子軌道表示］ | 計算でグラフィック用出力を指定したとき(キーワードgraphf)、その出力を読み込んで分子軌道を表示します。3D表示も可能です。 | |
| ［Import］▶ | ||
| ［Charge, Dipole (arc)］ | arcファイルをを読み込んで、電荷や双極子モーメントを表示します。 | |
| ［Animation (arc)］ | arcファイルをを読み込んで、構造表示やアニメーション連表示を行います。 | |
| ［IRC, STEP (out)］ | IRC計算の構造出力を読み込んで、連続表示を行います。 | |
| ［Force (out)］ | 振動解析結果を読み込んで、赤外線吸収スペクトルと振動の表示を行います。 | |
| ［FMO］▶ | ||
| ［PDB Edit] | PDB Editorを起動します。 | |
| ［FMOutil] | FMO Utilityを起動します。 | |
| ［GAMESSキーワード］▶ | キーワード欄をGAMESS用パラメータに差し替えます。 | |
| ［Setup] | GAMESSのキーワードを設定するウィンドウを表示します。 | |
| ［Import] | 保存済みのGAMESS形式データから、キーワード部分をインポートします。 | |
| ［NCPUS] | 計算に使用するCPU（コア）の数を指定します。 | |
| ［NODES(PC-Gamess)] | 並列計算に使用するフォルダの名前を指定します。 例 d:\node1 d:\node2 d:\node3 d:\node4 | |
| ［Start GAMESS］ | 現在の分子構造・キーワードでGAMESS入力ファイルを生成し計算を実行します。 外部基底関数ファイルを使用するには($BASIS EXTFIL=.T.)、basis.libをGAMESSのEXEファイルと同じディレクトリに置きます。WinGAMESSの場合は、runscript.cshの中で、setenv EXTBAS ../basis.libと指定します。 |
|
| ［Start GAMESS(2)］ | [パスの設定] − [(2)GAMESSのパス]で指定したプログラムを起動します。 | |
| ［Edit out(log)］ | GAMESSの標準出力ファイル(.out)を指定エディタで開きます。 | |
| ［Import］▶ | ||
| ［Animation］ | GAMESSの標準出力ファイル(.out)を読み込んで、最適化過程の座標変化を表示します。 | |
| ［MO, UV, Charge, Dipole, NMR ］ | GAMESSの標準出力ファイル(.out)を読み込んで、構造、分子軌道、NMRスペクトルなどを表示します。3D表示も可能です。 基底関数に関する制限はなくなりました。（V.3.802以降） | |
| ［Hessian, Raman］ | 振動解析結果を読み込んで、赤外・ラマン吸収スペクトル表示と振動の表示を行います。 | |
| ［GAMESSのホームページ］ | ||
| ［Gaussianキーワード］▶ | ||
| ［Setup] | Gaussianのパラメータを設定するウィンドウを表示します。 | |
| ［Import] | 保存済みのGaussian形式データから、パラメータ部分をインポートします。 | |
| ［G09 Start］ | 現在の分子構造・キーワードでGaussian入力ファイルを生成し計算を実行します。 | |
| ［Edit log(out)］ | Gaussianの出力ファイルを指定エディタで開きます。 | |
| ［Import］▶ | ||
| ［Animation］ | Gaussianの出力ファイル(.out)を読み込んで、最適化過程の座標変化を表示します。 | |
| ［Anim_Opt (IRC, modred)］ | Gaussianの出力ファイル(.out)を読み込んで、最適化構造を表示します。 | |
| ［MO, UV, Charge, Dipole, NMR］ | Gaussianの出力ファイル(.out)を読み込んで、構造、分子軌道、NMRスペクトルなどを表示します。3D表示も可能です。 基底関数に関する制限はなくなりました。キーワードに"gfprint"と"pop=full"が必要です。 （V.3.802以降） | |
| ［Freq］ | 振動解析結果を読み込んで、赤外・ラマン吸収スペクトルの表示と振動の表示を行います。 | |
| ［FormChk］ | G03WユーティリティのFormchkを起動し、.chkファイルから書式付の.fchファイルを作成し、表示します。 | |
| ［Import Fchk（CubeGen)］ | G03WユーティリティのCubegenを起動し、.fchファイルを読込んでCubeファイルを作成します。 | |
| ［Import Cube］ | Cube形式ファイルを読込んで表示します。3D表示も可能です。GAMESSのpunファイルの場合は、Cubeファイルに変換します。 | |
| ［UNUX Server］ | rsh ,ftpによるLinux(UNIX)マシンのリモートジョブ制御を行います。Gaussianの実行・制御が可能で、LSFにも対応しています。（Winmostarでは利用できません。） | |
| ［CNDO/S キーワード］▶ | ||
| ［Setup］ | CNDO/S用パラメータを設定します。 | |
| ［Import］ | CNDO/S形式ファイルを読み込んで、キーワード部分をインポートします。 | |
| ［CNDO/Sスタート］ | CNDO/S計算を実行します。 | |
| 日本コンピュータ化学会に登録されている旧JCPEの P083(CNDO/S：紫外・可視吸収スペクトル計算）（ マニュアル）です。 二つのプログラムを一つにして、Winmostarから起動できるように修正を行い、Cygwinのg77でコンパイルしてcndosw.exeを作成しました。 ソースプログラム(cndosw.f)もWinmostarのインストールディレクトリに同梱されています。 | ||
| ［UV-VISｽﾍﾟｸﾄﾙ表示］ | CNDO/S計算結果から紫外・可視スペクトルと分子軌道を表示します。 | |
| ［Edit CNDO/S OutFile] | CNDO/S出力ファイルをエディタで開きます。 | |
| ［MOSF］▶ | ||
| ［MOSFパラメータをセット］ | キーワード欄をMOSF用パラメータに差し替えます。 | |
| ［MOSFスタート］ | MOSF計算を実行します。 | |
| ［UV-VISスペクトル］ | MOSF出力から紫外・可視スペクトルを表示します。 | |
| ［エディット MOSF ファイル］ | MOSF 出力ファイルを指定エディタで開きます。 | |
